晋中水厂次氯酸钠消毒和杀菌主要的作用方式是通过它的水解作用形成次氯酸，次氯酸再进一步分解形成新生态氧[O]，新生态氧的极强氧化性使菌体和病毒的蛋白质变性，从而使病原微生物致死。
晋中水厂次氯酸钠为澄明微黄的水溶液，含次氯酸钠5%，性质不稳定，见光易分解，应避光密封保存。本品有很强的杀菌作用，对组织有较大的刺激性，故不用做创伤的消毒剂。常用于家禽用具、禽舍及环境消毒。用法与用量01%，0.02%水溶液用于家禽用具、器械的浸泡消毒，消毒时间为510 min;0.3%水溶液每立方米空间30， 50 mL用于禽舍内带鸡气雾消毒；1%水溶液每立方米空间 200 mL用于禽舍及周围环境喷洒消毒。
晋中水厂次氯酸钠在杀菌、杀病毒过程中，不仅可作用于细胞壁、病毒外壳，而且因次氯酸分子小，不带电荷，还可渗透入菌（病毒）体内与菌（病毒）体蛋白、核酸和酶等发生氧化反应或破坏其磷酸脱氢酶，使糖代谢失调而致细胞死，从而杀掉病原微生物。