数控卧式加工中心通常要处在不超30摄氏度的环境下才能正常运行，通常情況下卧式加工中心的配电柜内都有安装排气扇和制冷机，以确保电子件和中央处理器处在恒温条件下运行。要是温度和湿度过高会造成控制系统的元器件寿命减低，引起卧式加工中心故障无端增多。湿度升高的话，灰尘就会在集成电路芯片上增多直接引起接触不良和短路的故障产生。
数控卧式加工中心的刀库容量可以根据被加工零件的工艺分析结果来确定所需数量，通常以典型零件在一次装夹中所需刀具数量来确定刀库的容量，卧式加工中心以选用40把刀左右的刀库为宜。
数控卧式加工中心的主轴转速与进给速度，需要高速切削或超低速切削时，应关注主轴的转速范围。特别是高速切削时，既要有高的主轴转速，同时也要具备与主轴转速相匹配的进给速度。