有干货特种集装箱、散货集装箱、液体货集装箱、冷藏箱集装箱，以及一些特种集装箱，如汽车集装箱、牧畜集装箱、兽皮集装箱等。
采用一定规格大小的货箱装运时，大型货箱需要用叉车甚至起重机械装卸和吊运，小型货箱仍可能采用人工搬运和装卸。为了提高装卸、运输效率，便于机械化操作，有效地保障货物的安全，货物集装箱发展很快。货物特种集装箱是一种大型、标准化货箱，它可把小型货箱或分散的货物集中装载，便于集中装卸吊运。大型的车站、码头均设有专门装吊集装箱的设备和工具，.大型港口还有集装箱码头。现在，集装箱正在由普通集装箱向冷藏、气调等集装箱发展，以确保新鲜果品的优良品质和货架寿命，使之取得良好的经济效益。
特种集装箱按装卸方式分为： 1，垂直装卸的集装箱 指用起重机进行装卸作业的集装箱。 2，水平装卸的集装箱 指带轮、有支脚式滑轮的集装箱(通常是指拖车式集装箱)。 3，可卸箱体 在集装箱的箱底有四个可折叠的支脚，用集装箱拖挂车运到目的地后，使用集装箱拖挂车上的液压装置将集装箱抬起，放下支脚，即可卸下集装箱。这种装卸方式不需要专们的装卸机械，也有利于集装箱拖挂车的有效利用。