步进电机用户通过对伺服驱动器的控制操作，伺服驱动器转换为对应的三相电输出进行控制。对伺服驱动器的控制操作方式，有三种的控制方式 位置，速度和转矩控制。位置，使用脉冲输入方式进行控制，其中又分为 AB相脉冲，正反脉冲和 脉冲+方向控制；速度和转矩，一般使用模拟量输入进行控制。
步进电机由于受到自身制造工艺的限制，如步距角的大小由转子齿数和运行拍数决定，但转子齿数和运行拍数是有限的，因此步进电机的步距角一般较大并且是固定的，步进的分辨率低、缺乏灵活性、在低频运行时振动，噪音比其他微电机都高，使物理装置容易疲劳或损坏。
步进电机精度：实现了位置，速度和力矩的闭环控制；克服了步进电机失步的问题；转速：高速性能好，一般额定转速能达到2000～3000转；适应性：抗过载能力强，能承受三倍于额定转矩的负载，对有瞬间负载波动和要求快速起动的场合特别适用；稳定：低速运行平稳，低速运行时不会产生类似于步进电机的步进运行现象。适用于有高速响应要求的场合；及时性：电机加减速的动态相应时间短，一般在几十毫秒之内；舒适性：发热和噪音明显降低。