微波烘干设备穿透性加热，加热速度快，均匀加热。其穿透的距离，在理论上与电磁波波长同数量级。因此宏观上表现为加热速度快，均匀性好，物体色泽，成份保持不变。微波加热是使用使被加热物体本身成为发热物体，称之为整体加热方式，不需要热传导的过程，因此能在短时间内达到均匀加热。
微波加热时物体各部位不论形状如何，通常都能均匀渗透电磁波，以产生热量，因此介质材料加热的无效性大大改善。微波加热与高频加热相比较不需在设计适合物形状的电极，所发不论何种开头的物体都能做到均匀加热，这一点对提高产品质量很有利。
微波比其它用于辐射加热的电磁波，如红外线、远红外线等波长更长，因此具有更好的穿透性。微波透入介质时，由于介质损耗引起的介质温度的升高，使介质材料内部、外部几乎同时加热升温，形成体热源状态，大大缩短了常规加热中的热传导时间，且在条件为介质损耗因数与介质温度呈负相关关系时，物料内外加热均匀一致。