超微粉碎机的原理是气流粉碎机与旋风分离器、除尘器、引风机组成一整套粉碎系统。粉碎过程依靠物料自身之间的碰撞来完成，有别于机械粉碎依靠刀片或锤头等对物料的冲击粉碎，因而设备耐磨损，产品纯度高。 可与多级分级机串联使用，一次生产多个粒度段的产品。控制系统采用程序控制，操作简便。
超微粉碎机粉碎后的物料在风机抽力作用下随上升气流运动至分级区，在高速旋转的分级涡轮产生的强大离心力作用下，使粗细物料分离，符合粒度要求的细颗粒通过分级轮进入旋风分离器和除尘器收集，粗颗粒下降至粉碎区继续粉碎。
超微粉碎机仓内碾轮进行自转和公转，对物料进行以重压研磨为主剪切原理为辅的混合作用力，使物料粉碎到一定细度，此种粉碎原理可以保证在不损坏物料的前提下达到超微粉的标准甚至细度更高，而且在不加冷却设施的前提下料仓内的工作温度相对较低，不超出45以保障物料不会因高温而变质。