加衬复合MBR膜运行时的活性污泥浓度为6000-10000mg/L(1)过高的污泥浓度会引起抽吸压力上升;微生物的自身降解率也会下降，而使出水水质变差，因此必须控制好污泥浓度在上限以下运行。(2)由于曝气量较大、膜的截留作用，膜生物反应池中的好氧微生物可保持在较高的浓度，利于有机物的降解。污泥浓度可保持在6000-10000 mg/L 的范围内。(3)过低的污泥浓度会使加快水中污染物对膜元件的污染速度;活性污泥浓度小于3000 mg/L时，可利用下列方法运行。①在较低的抽吸流量下运行，一般为正常运行的30%-40%。②停止抽吸，对污水进行间歇曝气，连续性少量进水，逐步提高污泥浓度。③实行闷曝:对泥水混合液进行曝气，停止进出水，补充营养液。
加衬复合MBR膜元件对原水硬度的要求，当水中硬度较高时，在长期使用过程中，钙盐、镁盐等沉淀物质会在滤膜和曝气管上结垢，严重影响滤膜及整个系统的正常工作，因此在处理硬度较高的污水时，需要对污水进行软化处理后才能使用膜生物反应器法
加衬复合MBR膜产水量的设定影响产水量的因素主要包括:膜本身的性能、膜组件的结构、曝气系统的设计、活性污泥的性能等，在恒流运行条件下，膜组件必须控制在临界过滤通量(1)以下抽吸运行，方能实现长期稳定的工作状态。注(1):过滤压差(TMP) 不随时间明显升高的产水量