双人方舱集装箱活动房需要注意做好防护措施：集装箱材料受本身金属结构物理特性的影响，热传导能力强，保温隔热性能差，使得室内热环境不稳定，需要另外设置保温隔热层才能有效控制室内热环境，并在南方地区需要对集装箱箱体进行遮阳处理以隔热，可以省去一笔能耗费用。
双人方舱集装箱活动房在定制时要考虑是否方便且可移动的检测。通过组装设计，集装箱可以快速拆卸并打包运输。底部的四个滚动轮有助于移动和转换到相应的工作地点，并大大提高了检测效率。
双人方舱集装箱活动房需要注意它的箱体容易锈蚀，需要为集装箱内外涂刷防锈油漆来阻止锈蚀，这一点很重要。