纯水系统1)做好原水的预处理工作，保证SOI＜4，同时要加杀菌剂，防止微生物的滋生。2)在RO运行中要维持合适的工作压力，一般工作压力增加产水量也增大，但过大又会使膜压实。3)在RO运行中应保持浓水的絮流状态，减轻膜表面溶液的浓差极化，避免难溶盐在膜表面析出。4)在RO停运时，短期应进行加药冲洗，长期应加CH2O保护液进行保护。5)当RO产水明显减小或含盐量高时，表面结垢或污染，应进行化学清洗。
纯水系统一般厂家给出膜的保质期为两年，两年后的产水量在同等压力下不低于80%，盐通过率不高于1.5倍。但质保期不是正常使用寿命，膜元件的寿命与进水水质、化学清洗、操作条件等诸多因素有关，很难确定。同样的膜可能用个两三年，也可能用三五年。
纯水系统1)改善絮粒结构，使其颗粒长大，强韧和沉重；2)调整被处理水的PH值和碱度，使其达到佳混凝条件，提高混凝效果；助凝剂本身不起混凝作用，但能促进水中杂质的混凝过程。