深孔加工刀具与机床的匹配，都会想到的是外形与尺寸的匹配。的确，外形和尺寸的匹配是刀具在机床上能够正确安装的基础。没有这个基础，深孔加工刀具无法被正确地安装在机床上。
深孔加工刀具刀杆受孔径的限制，直径小，长度大，造成刚性差，强度低，切削时就很容易产生振动、波纹、锥度，从而影响深孔的直线度和表面粗糙度。
深孔加工刀具刀柄本身而言，在被磨去一部分材料形成压力面时，刀柄部分即与刀具的回转中心不重合了。在刀具夹紧的过程中，削平柄被锁紧螺钉推向已经偏离中心的那一侧，刀具将进一步偏离刀具在机床上的回转中心，这些都增加了刀具的不平衡。