MBR加衬膜上发生了污染，就会使抽吸压力上升，如果不采取措施继续运行会使产水量下跌，因此必须进行清洗使膜性能恢复。清洗周期:一般1个月要在线清洗一次。2) 酸洗: 配制1000mg/L 草酸溶液，在线清洗，水量同上，浸泡1小时。2 物理清洗当在线化学清洗无法解决问题时，需要将膜元件从组件取出，放在平整的地面或干净容器中，用压力水柱冲洗膜表面。
MBR加衬膜离线化学清洗膜元件经物理清洗后，再置于容器内，向容器内加入与在线清洗相同的化学清洗剂，浸泡5 小时以上，可使滤膜的过滤能力得到有效的恢复。
MBR加衬膜膜元件取出清洗后，应及时放入反应池中或用清水浸泡储存，避免阳光直晒和膜表面干燥。清洗周期:一般在6 个月要体外清洗一次。