常见的焊缝缺陷分外观缺陷和内部缺陷。外观缺陷可用肉眼观察到，内部缺陷需通过设备、仪器才能检查出来。焊缝缺陷影响焊缝有效截面面积，使焊缝金属的强度降低。裂纹缺陷还造成应力集中，有可能造成断裂。焊缝主要缺陷是咬边、未焊透与未熔合、夹渣、气孔和裂纹。其中，管焊裂纹是焊接中不允许出现的一种严重缺陷，应采取措施予以防止
采用药芯焊丝加气体保护的焊接工艺，若是多遍成型，则每次焊缝表面清渣费工费时；若是强迫成型，则须配加一个与焊一起运动的成型铜滑块，并通入循环冷却水，可以大大提高管焊效率，这样一来不仅焊接装置的结构复杂，而且重量增加。因为药芯焊丝的价格较高，同时还要解决保护气体的气源，所以焊接成本较高。单一使用自保护焊丝，虽然节省了保护气体，但存在清渣困难问题。
系统法兰焊接是配管制作中的难点。如果焊接工艺不对很容易发生法兰变形凸起的情况。管焊时环境温度过低、焊接区与非焊接区及焊层间温差大会造成法兰壁应力分布不均引起焊接质量差。采取相应措施（如感应加热等）保证焊接区与非焊接区间温差不大，焊层间温差保持不超过200℃，可有效地解决法兰变形问题。)管路焊接后要进行焊缝质量检查