双轴数控深孔机床被加工的工件由主轴箱和集屑器的锥顶盘顶紧，钻头由钻杆箱带动高速旋转实现切削运动，伺服电机带动滚珠丝杠推动钻杆箱实现进给运动，授油器将高压冷却油由钻头的尾部注入，从钻头的内孔直达工件的切削部位，钻屑由冷却液沿钻头的导屑槽冲到集屑器，进入集屑斗，冷却液经滤纸和磁过滤后回到油箱继续使用。
双轴数控深孔机床加工过程中，注意观察后部磁排屑机出屑情况，以做及时判断。因为整个加工状态为封闭式，可根据铁屑状态对切削参数做出及时调整。
双轴数控深孔机床装夹工件一定要牢固，必须遵循“装实、装正、装平”的原则，严禁在材料悬空的地方进行加工。