农药废弃物处理涉及到农药生产、经营企业和广大农村的千家万户。当前，食品安全已经成为我国政府和公众普遍关注的民生问题，农业面源污染正在成为农业环境治理的重点领域，因此科学使用农药和合理处置农药废弃物的工作也应引起政府和公众的重视，共同保护农业生态环境。
废弃农药样品不能丢放，要妥善处理。完好无损的可由销售部门或生产厂统一回收。高毒农药的破损包装物要按照高毒农药的处理方式进行处理。具体讲，金属罐和桶，要清洗，爆坏，然后埋掉，在土坑中容器的顶层距地面50厘米；玻璃容器要打碎并埋起来；杀虫剂的包装纸板要焚烧；除草剂的包装纸板要埋掉；塑料容器要清洗、穿透并焚烧。焚烧时不要站在火焰产生的烟雾中，让小孩离开，此外，如果不能马上处理的容器，则应把他们洗净放在安全的地方。总之，要特别注意不要用盛过农药的容器装食物或饮料，因为由此产生的中毒实例很多。
正规处理肯定是要焚烧的。由于农药瓶有多种材质，大部分材质即便深埋也不能被微生物降解处理，所以深埋也不是正规的操作。 而焚烧处理是需要由正规公司处理的，这些公司是需要经过政府安环部门批准才能经营的。处理的费用也不低，但是不处理的话，农药瓶对环境的危害也比较大。