发酵罐控制部分：其功能主要是将测定元件测出的各种参数信号与预先确定值进行比较，并且输出信号指令执行元件进行调整控制。执行元件：它接受控制部分的指令开启、或关闭有关阀门、泵、开关等调节控制机构，使有关参数达到预定位置。关于控制方式，有手动控制和自动控制两类：手动控制：这是简易的控制方法。发酵罐的清洗工作也同样重要。
发酵罐分批发酵培养基后，在一个培养体积中接种细胞和添加中途不添加也不更换培养基的方式。 优点:污染杂菌比例小，发酵罐操作灵活，可进行不同产品的生产。缺点:效率低，非稳态工艺过程设计和操作困难(培养过程中细胞生长、产物积累、以及培养基的物理状态常常随时间变化而变化)连续发酵在培养过程中，不断向反应器中流加新鲜培养基，同时以相同的流量从系统中取出培养液，从而维持培养系统内在细胞密度、产物浓度以及物理状态相对平衡的培养方式。
发酵罐节能发酵罐的高径比发酵厂房高度增加，造价增大.近年新建发酵罐容积趋向大型化，从100罐到250罐、660罐，甚至更大。但综合考虑，发酵罐直捅高度不宜过高,以不超过14m为宜。高径比H／￠：当发酵罐高度限定在一定范围内。发酵罐容积增大，罐径随之增大，H／￠减少,发酵罐由细长型逐变为矮胖型。一般H／￠控制在3之内为宜。