水稻烘干机在冷却过程中，冷空气先接触下部的低温粮食，在向上运行的同时吸收玉米中的热量，冷空气温度逐渐升高，这样可避免冷风与上层热粮接触时稻谷的急剧冷却，逆流冷却既可以提高冷却段的冷却效果，还可以保护粮食的品质不受影响。
水稻烘干机选用顺流烘干工艺，采用热空气作为热介质烘干粮食。其内部主要由进气通风节和角状通风盒组成。角状盒外充溢粮食，粮食自上而下活动，热空气由进气通风节进入，向下方向穿过粮层，废气经排气角状盒排出。热空气与粮流同向活动。
水稻烘干机燃料一般采用煤，电，生物颗粒等，烘干成本低。设有冷却段，冷风机负责向冷风段内提供冷空气，采用逆流冷却方式对烘后粮进行降温。