与台式集装箱相比，一些特种集装箱简化了规划结构，只保留了底板，可用于装卸严重货物。例如，严重的机械设备、严重的钢材等。由于这些严重的货物的长度、宽度和高度都很大，因此需要特殊的集装箱平台结构来包容装卸。
定制特种集装箱具有基本的防腐、防水、防火能力，其材料重量轻，提供更方便的运输和处理，采用拼接安装结构，可将标准部件运至现场安装，组装过程不需要设备，是劳动力成本节约。
特种集装箱是一种特殊的集装箱类型，通常是专门为了满足特定的功能而制造的。例如，用于运输冷冻食品的特种集装箱的内部结构相当于低温冰箱。许多人也称之为冷藏集装箱。它配备了隔热装置，并有专门的通风口运输空调，以确保鱼、虾、肉和新鲜水果在长途运输中仍然新鲜。