核酸检测亭在定制时要考虑消毒问题，要求简单方便。紫外线杀毒，可以在工作前对采集站进行自助消毒，并确保无菌和卫生。
核酸检测亭需要注意做好防护措施：集装箱材料受本身金属结构物理特性的影响，热传导能力强，保温隔热性能差，使得室内热环境不稳定，需要另外设置保温隔热层才能有效控制室内热环境，并在南方地区需要对集装箱箱体进行遮阳处理以隔热，可以省去一笔能耗费用。
核酸检测亭在定制时要考虑是否方便且可移动的检测。通过组装设计，集装箱可以快速拆卸并打包运输。底部的四个滚动轮有助于移动和转换到规定的工作地点，并大大提高了检测效率。