不同型号的十二指肠镜维修不同，弯曲角度的大小和方向也不相同，新出厂的镜子，均已按要求调好，当使用一个阶设，由于钢丝的伸长而使角度变小，造成诊断上的盲区，当术者感到不便而强行操作时，会拉断钢丝或使焊接点脱焊。这是个常见的故障。
送气、送水及吸引按钮的维护，钳子阀门垫的更换和组装，称为三项维护，是十二指肠镜维修前本身固有的常出故障的地方。
十二指肠镜维修时注意胃肠镜先端部的保护，避免意外硬物的碰撞，造成先端盖玻璃片的裂痕、缺失、破碎。
