方舱集装箱活动房在定制时要考虑消毒问题，要求简单方便。紫外线杀毒，可以在工作前对采集站进行自助消毒，并确保无菌和卫生。
方舱集装箱活动房注意要寻找一家可靠的制作厂商。集装箱定制是一项不小的工程为了能在质量及相关条件上达到定制要求，就需要对找一家大规模可靠的定制厂商，厂家可靠才能在加工技术及材料选用上更有保障，还能保障在定制好后能减少使用过程中的各种故障问题，并能集装箱定制的质量提供保障避免各种不良现象的发生。
方舱集装箱活动房需要注意做好防护措施：集装箱材料受本身金属结构物理特性的影响，热传导能力强，保温隔热性能差，使得室内热环境不稳定，需要另外设置保温隔热层才能有效控制室内热环境，并在南方地区需要对集装箱箱体进行遮阳处理以隔热，可以省去一笔能耗费用。