第三方冷库管理系统支持多种计费方式，可按零仓计费也可按包仓计费。其中零仓计费支持按吨、按板、按件等多种方式计费，包仓计费支持按天、按月等多种周期计费。同时也支持自定义收费如增值服务费等，可自定义收费标准。费用自动实时计算，随时可以结转，并生成相应的费用清单和结算报表，便于收款。
第三方冷库管理系统主要由计算机软件系统和硬件设备组成。软件系统的主要功能包括出货主资料、出入库管理、库存管理、财务管理、温湿度管理、供应链管理等等；硬件设备通常包括手持终端设备、AGV、自动码垛机等等，其中手持终端设备是系统重要的一个组成部分，通过手持终端，冷库现场作业将更加简便。
第三方冷库管理系统的应用场景如下： 1、冷链物流园区、农贸批发市场等交易型冷库。2、农产品等生产加工自用型冷库。3、第三方冷链仓储、配送中心、中央厨房等周转形冷库。