与台式集装箱相比，一些水利集装箱简化了规划结构，只保留了底板，可用于装卸严重货物。例如，严重的机械设备、严重的钢材等。由于这些严重的货物的长度、宽度和高度都很大，因此需要特殊的集装箱平台结构来包容装卸。
水利集装箱属于一种移动式房屋，由承载骨架、墙板、屋顶、地板、门窗等部件组成，主要特点是整体承载骨架、墙板、屋顶、地板填充保温材料，使其具有不同等级的保温、密封性能，可连接设备整体运输。
水利集装箱的应用改写了人们对集装箱应用的固有印象。目前，许多流行的水利集装箱已应用于生产和运输，如运输冷冻食品、运输特种货物、装卸严重货物等。