有机肥料餐厨垃圾处理机将转运来的餐厨垃圾或果蔬垃圾等通过自动提升机倾倒入分拣平台，经人工分选将其中的塑料和纸质包装类垃圾以及少量玻璃瓶、金属物料、砖瓦等无机物料分选出来后，进入破碎机破碎分解，然后进入螺旋挤干机进行脱水处理，脱除下来的渗滤液进行油水分离后排入污水管道。挤压产生的含固率在百分之40以上的干物料经由皮带输送机送入高温搅拌发酵仓内进行高温好氧发酵处理。
有机肥料目前，对于多数餐厨垃圾处理技术较落后或垃圾分类不严格的地方，通常餐厨垃圾会与生活垃圾一起焚烧处理。焚烧处理法对于垃圾减量化很有效，能够达到减量百分之90或更高。对于一些技术较发达的地区，垃圾焚烧厂会利用垃圾焚烧产生的热量发电，以获得经济效益。但由于餐厨垃圾的特殊性质，垃圾焚烧处理会产生大量的有害气体，不能满足无害化的要求。对于霉变、严重变质和已被化学污染的餐厨垃圾则应采用焚烧法进行处理。
有机肥料餐厨垃圾预处理机（机械处理机）采用物理原理，通过机械运动的方式对餐厨垃圾就地进行分拣去杂、破碎、脱水等处理，大限度的降低泔水的含水量和体积及重量，实现油水分离和污水处理，处理后的餐厨垃圾生成适合运输的有机物质运至集中有机肥料工厂，分离后的油脂运至生物柴油厂集中处理。