有干货特种集装箱、散货集装箱、液体货集装箱、冷藏箱集装箱，以及一些特种集装箱，如汽车集装箱、牧畜集装箱、兽皮集装箱等。
特种集装箱1、开顶集装箱：用于装载玻璃板，钢制品，机械等重货，可以使用起重机从顶部装卸，开顶箱顶部可开启或无固定项面的集装箱。 2、框架集装箱：用于长大、超重、轻泡货物。 3、罐装集装箱：用于液体货物。 4、平台集装箱：用于装运超限货物，有一个强度很大的底盘，在装运大件货物时，可同时使用几个平台集装箱。 5、冷冻集装箱：用于运输黄油、巧克力、冷冻鱼肉、炼乳、人造奶油等物品。 6、框架集装箱：用于超重货物，装载牲畜，以及诸如钢材之类可以免除外包装的裸装货。
特种集装箱按装卸方式分为： 1，垂直装卸的集装箱 指用起重机进行装卸作业的集装箱。 2，水平装卸的集装箱 指带轮、有支脚式滑轮的集装箱(通常是指拖车式集装箱)。 3，可卸箱体 在集装箱的箱底有四个可折叠的支脚，用集装箱拖挂车运到目的地后，使用集装箱拖挂车上的液压装置将集装箱抬起，放下支脚，即可卸下集装箱。这种装卸方式不需要专们的装卸机械，也有利于集装箱拖挂车的有效利用。