晋中水厂次氯酸钠消毒和杀菌主要的作用方式是通过它的水解作用形成次氯酸，次氯酸再进一步分解形成新生态氧[O]，新生态氧的极强氧化性使菌体和病毒的蛋白质变性，从而使病原微生物致死。
晋中水厂次氯酸钠无色至浅黄绿色液体，存在铁时呈红色，含有 效氯10%〜12%。为快速、广谱消毒剂，可有效杀灭各种 微生物，包括细菌、芽孢、病毒、真菌等。饮水的消毒，每立方米 水加药30〜50毫克，作用30分钟；环境消毒，每立方米水加药 20〜50克搅匀后喷洒、喷雾或冲洗；食槽、用具等的消毒，每立方米水加药10〜15克搅匀后刷洗并作用30分钟。
晋中水厂次氯酸钠在杀菌、杀病毒过程中，不仅可作用于细胞壁、病毒外壳，而且因次氯酸分子小，不带电荷，还可渗透入菌（病毒）体内与菌（病毒）体蛋白、核酸和酶等发生氧化反应或破坏其磷酸脱氢酶，使糖代谢失调而致细胞死，从而杀掉病原微生物。