对微生物的杀灭主要是依靠其强大的氧化作用，因此不会产生抗药性，而且它对细菌、真菌和病毒同样有效。 50双氧水常见的浓度3%的双氧水能够轻松杀灭金黄色大肠菌、丙肝等致病微生物。 即使是生命力极为顽强的细菌芽孢，用10-30%浓度的双氧水也能杀灭。
50双氧水的氧化性能损坏天然色素，因此可以漂白纸张、织物和食品，目前全世界一半以上的用于纸浆和纸的漂白。 在中国，常用于水发制品，例如鱿鱼、蹄筋、牛肚等，在开心果、腐竹、泡椒凤爪、猪蹄等食品中也有使用。
50双氧水还有淡化毛发颜色的功能，对于那些因汗毛过长而影响美观的女性，可在脱毛后，用双氧水直接涂于皮肤上，每日2次，这样日后长出的汗毛就不会变的黑粗，而会变得软且颜色为淡黄。