在冷链仓库管理系统的应用之下，冷库内的所有作业数据都会自动采集更新到系统中，出入库也不例外。冷链仓库管理系统具有货主端，货主通过登录货主账号，即可实时查看库存总量与变动信息。此外，如货主有使用系统的移动端，也能在移动端上接收货品出入库相关通知。
冷链仓库管理系统具有欠费限额功能，企业可以在系统中设定欠费限额上限，如2000元，当货主欠费金额达到2000元时，系统会自动禁止该货主的货品出库，减少冷库的损失，直到货主缴清款项后才能恢复正常。
冷链仓库管理系统内嵌多种算法，可灵活计算货主的冷藏费用与其他费用，支持包仓与零仓等多种计算方式，也可自定义收费标准与自定义收费。