集装箱商铺租赁的方式有以下几种：长期租赁：长期租赁是指租户与集装箱商铺的所有者签订长期的租赁合同，租赁期限一般为3年以上。长期租赁的优点是租户可以稳定地使用集装箱商铺，但需要支付较高的租金。短期租赁：短期租赁是指租户与集装箱商铺的所有者签订短期的租赁合同，租赁期限一般为1年以内。短期租赁的优点是租户可以灵活地调整租赁期限，但需要支付较高的租金。转租：转租是指租户将集装箱商铺转租给其他租户，从中获取租金收益。转租的优点是租户可以通过转租获得额外的收益，但需要承担转租过程中的风险和手续。以上是集装箱商铺租赁的主要方式，租户可以根据自己的需求和情况选择合适的租赁方式。