食品包装许可证分类的设定有助于对市场形成有力的刺激，比如此前我国食品生产许可分类中并没有运动营养食品这一项，也没有相应的审查细则。而在强烈的市场需求推动下，企业又不会放弃这块巨大的蛋糕，因此企业生产运动营养食品只能向相关产品类别如固体饮料、糖果制品等分类贴近。没有统一的规范意味着下游市场的混乱，而生产许可的明确分类将使生产企业有据可依，生产积极性大为提高。
特殊食品在消费者心理也是“特殊“的存在，其担负了消费者所寄予的“期望，所以在产品选择上往往存在盲目性。食品包装许可证的本质虽然是强化企业的主体责任，但也有助于引导消费者认知的提高，从顶层理清特殊食品的定位。
食品包装许可证是一种食品质量安全市场准入标志，没有该标志的产品也意味着不能上市销售。