三轴桩机对于以埋设护筒未开钻或成桩护筒未拔除的应加设护筒顶盖或铺设安全网遮罩；泥浆池应设明显警示标志和防护栏杆，桩基施工完成后，及时清理泥浆防止污染环境，并回填泥浆池。
三轴桩机就位后，要对钻机极其配套设备，进行检查，如卷扬机、钢丝绳、钻头、泥浆泵、水泵及电气设备等设备是否完好正常；钻机安设必须平稳、牢固，钻架应加设斜撑或缆风绳。钻机平台和作业平台，特别是水上钻机平台应搭设坚固牢靠，并满铺脚手板，设防护栏杆、走道。杂物及障碍物应及时清除。
三轴桩机钻孔过程中，必须设有专人，按规定指标保持孔内水位的高度及泥浆的稠度，以防塌孔，钻孔使用的泥浆应设置泥浆循环净化系统，防止对环境的污染。