清洁生产办理流程在方案筛选过程中，对于投资少的无/低费方案继续实施。并与末端治理效果表进行列表比较，同时向职工宣传实施效果，调动广大员工参与清洁生产的积极性。至此，我们还要编报清洁生产方案的中期报告。
清洁生产办理流程分为七个阶段：筹划和组织、预审核、审核、方案的产生和筛选、可行性分析、方案实施和持续清洁生产。
对清洁生产办理流程而言，清洁生产包括节约原材料，减少生产过程中可能产生的有毒、有害污染物，减少生产过程中的各种危险性因素，采用可靠和简单的生产操作和控制方法，对物料进行内部循环利用，完善生产管理，不断提高科学管理水平等。对产品而言，就是产品应具有合理的使用功能和使用寿命；产品本身及在使用过程中，对人体健康和生态环境不产生任何不好影响和危害；产品失去使用功能后，还要易于回收、再生等。