电子内镜的送气、送水及吸引活检孔道设计与纤维镜相同，电子内镜光源内亦装有电磁气泵与送气、送水管道相通，内镜与光源接头处有吸引嘴与负压吸引端相接。
由于人体生理结构所限，为了能顺畅地进入人体，并且观察到特定部位的图像，胃肠镜都配有上、下、左、右四个角度。在使用过程中频繁打角度，久而久之，就会出现机械磨损的弊病，当然，要具体问题具体分析。
这种故障常见于前端弯曲橡皮部、插入管和导光管上，由于软镜频繁使用、保养不到位或消毒时消毒水的腐蚀，保存的空间与环境（温度，湿度）不符合要求，都会引起插入管和导光管表皮光泽度下降，表面起皮粗糙，还有，使用者操作不当也会导致插入管被咬，被压，甚至破裂。