电子内镜的送气、送水及吸引活检孔道设计与纤维镜相同，电子内镜光源内亦装有电磁气泵与送气、送水管道相通，内镜与光源接头处有吸引嘴与负压吸引端相接。
由于人体生理结构所限，为了能顺畅地进入人体，并且观察到特定部位的图像，胃肠镜都配有上、下、左、右四个角度。在使用过程中频繁打角度，久而久之，就会出现机械磨损的弊病，当然，要具体问题具体分析。
如果电子镜同时接通图像处理中心和光源，仍然没有图像或者花屏、黑屏，在排除接线座问题后，就是CCD有损坏。还有，部分CCD损坏图像会伴有干扰、条纹、图像不稳定现象。