审计业务档案整理的方法是编号分类法，步骤共有七步，分别是收集、筛选、分类、确定、修缮、编号以及装盒并编制目录。
“审计业务档案整理工作的主要内容是什么 档案的收集、整理、保管、鉴定、统计和提供利用的活动。包括：档案收集、档案整理、档案价值鉴定、档案保管、档案编目和档案检索、档案统计、档案编辑和研究(见档案文献编纂)、档案提供利用。 这8项工作的划分只是相对稳定而不是绝i对的，也有分为 6个环节的，也有分为基础工作和利用工作两大部分的。由于现代档案管理工作已成为复杂的系统，故也有按多层次进行划分的方法。其第yi层次分档案实体管理和档案信息开发两个子系统，各子系统又下分若干层次小系统。 档案实体管理分收集、整理、鉴定、保管、统计等工作环节；档案信息开发又分信息加工和信息输出两部分，信息加工由编制目录、编辑文献汇编和编写参考资料构成，信息输出由提供阅览、复i制、咨询、函调、外借以及出版、展览等多项服务活动构成。
“审计业务档案整理保管制度 1、档案实行专人管理，非档案管理人员不得随便开启档案箱、橱。 2、不得利用工作之便私自摘录、擅自为他人查阅档案，不得向外传播和介绍档案、资料内容及存放位置等情况。 3、科学管理档案，档案查阅完毕，随时归还原处；档案按保管期结合年代排列存放，资料按类别排列存放。 4、档案箱、橱进行统一编号，自门口开始从左至右，自上而下编号。 5、维护档案安全，每个箱橱必须保持整洁，并放置防霉去虫剂。 6、档案人员调动工作时，应在离职前办理交接手续。