（2）修剪 修剪目的是通风透光、调节营养配给。有春剪和夏剪之分。在无冻害的年份和地区也可在冬季修剪，但对2cm以上的伤口要用石蜡、泥土等进行密封保护。木瓜修剪要求先大枝后小枝，先外后内，先下后上。修剪后达到内外枝叶分布均匀，树枝布局合理，太阳从树顶照下，树影成筛子眼，树体无大空，树干不光秃。春季修剪一般在2月中下旬至3月上旬进行，其方法是对已进入结果期的树进行疏剪和短截。夏季主要是摘心，抹芽，疏幼果。此项工作在生长期要经常进行，以利于结果的产量和质量。
炭疽病 炭疽病危害果、枝、叶。发病初期，果实上的“小褐点”迅速扩大成斑致使整个果实腐烂，病果在湿度大的情况下产生粉红色液，失水后成僵果。轮纹病、炭疽病皆以病原潜伏于病枝、果中越冬，遇高温高湿条件即产生分生孢子进行初次侵染和复染。发病高峰在每年5月份后的每一次降雨。传统防治除冬季修剪病枝、除僵果病叶并集中烧毁的农业防治外，还采用在冬季喷施3－5度石硫合剂、4月底喷70%甲基托布津1000倍液(每隔10天喷1次)、5月底6月初喷75%百菌清500倍液2次以上。
采种 木瓜定植后3－5年开花结果。8－9月当外果皮呈青黄色时即可进行采收。将采回的鲜果剖开，掏出种子凉干，选取子粒饱满的留种；也可在11月果皮风干后，削开果实，取出种子，进行留种。