清洁生产办理过程在方案筛选过程中，对于投资少的无/低费方案继续实施。并与末端治理效果表进行列表比较，同时向职工宣传实施效果，调动广大员工参与清洁生产的积极性。至此，我们还要编报清洁生产方案的中期报告。
清洁生产办理过程在确定好方案后，我们需要制定一个方案实施进度计划标准，对于资金筹备及落实、技术改进、设备考察订购及安装调试、车间清理准备、人员培训情况、试运行、验收等情况进行跟进。这阶段需要企业领导和审核小组在项目完成后进行跟踪分析, 总结取得的环境效益和经济效益, 以及实施清洁生产的经验, 并与实施前进行对比，
清洁生产办理过程分为七个阶段：筹划和组织、预审核、审核、方案的产生和筛选、可行性分析、方案实施和持续清洁生产。