对微生物的杀灭主要是依靠其强大的氧化作用，因此不会产生抗药性，而且它对细菌、真菌和病毒同样有效。 双氧水常见的浓度3%的双氧水能够轻松杀灭金黄色大肠菌、丙肝等致病微生物。 即使是生命力极为顽强的细菌芽孢，用10-30%浓度的双氧水也能杀灭。
双氧水的氧化性能损坏天然色素，因此可以漂白纸张、织物和食品，目前全世界一半以上的用于纸浆和纸的漂白。 在中国，常用于水发制品，例如鱿鱼、蹄筋、牛肚等，在开心果、腐竹、泡椒凤爪、猪蹄等食品中也有使用。
清洗伤口 这是双氧水常见的用途。 摆脱和脓疮 脸上长了痘痘，可以用棉签蘸取一点将稀释后的双氧水，给痘痘，一天一次。马上能看到显著的变化。