货运代发清关费用包括：1、需要征税费、查验的货物，自接受申报起1日内办结通关的手续费。2、载运进出口货物的各种运输工具进出境或转运，向海关申报，办理海关的手续费。3、进口的过程是整个一批货物所产生的进口关税和进口增值税。4、出口货物的发货人在根据出口合同的规定，按时、按质、按量备齐出口货物后，向运输公司办理租船订舱的运输费，向海关办理报关手续，或委托（代理）报关公司办理报关的手续费。
货运代发海关出口货物报关的运费一般都是根据贸易方式来规定的；1，FCA就是(货交承运人）这种一般只需要交到客户的货代手里即可，并办理一个出口报关手续，这种一般只是国内运输费用以及报关费；2，FOB(装运港船上交货）这种涉及到上船前的一切费用归买方；涉及国内运费以及报关费用，海运拼箱费，提单费以及操作费和杂费；3，CIF（目的港交货）这种涉及到目的港的一切费用；还涉及保险费用以及运输费用以及国内运输费用和国内的一些杂费；
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