水族馆设计安装中循环系统也是非常重要的，循环系统是维生系统的重要组成部分，主要有水泵、连接管材、阀门、砂缸组成。占地面积大小，管口的预留预埋、管路的安装顺序、选用水泵的流量、扬程、吸程、进出口口径、水泵的材质都是施工的重点。
水族馆设计安装中注意要系统测试与调试。待全部设备安装完成后，检查管路敷设和各系统之间的接口情况是否全部符合有关规范及设计要求;确认系统运转的各项指标达到设计标准要求后系统投入自运行。
水族馆设计安装要注意培养水及系统调整。全部整体工程完工后，整个循环系统需在无鱼条件下进行为期一个月的运转测试。