沉管碎石桩机钻孔过程中，必须设有专人，按规定指标保持孔内水位的高度及泥浆的稠度，以防塌孔，钻孔使用的泥浆应设置泥浆循环净化系统，防止对环境的污染。
沉管碎石桩机就位后，要对钻机极其配套设备，进行检查，如卷扬机、钢丝绳、钻头、泥浆泵、水泵及电气设备等设备是否完好正常；钻机安设必须平稳、牢固，钻架应加设斜撑或缆风绳。钻机平台和作业平台，特别是水上钻机平台应搭设坚固牢靠，并满铺脚手板，设防护栏杆、走道。杂物及障碍物应及时清除。
沉管碎石桩机施工现场采用三级配电，两级漏电保护，所用电设备铁壳必须有保护接地，班中停止作业1h时以上相关动力开关箱应断电上锁，暂时不用的配电装置也应断电上锁。室外使用220V灯具照明，不得在工地使用护导线、花线等电线接通灯具和用电设备，必须使用黑色电缆线，工地照片灯具不得使用简易碘钨灯，室外设高度不低于3m室内不低于2.4m。在雷雨天钻机应停止作业，防止施工人员被雷击中。