综合档案管理系统是指将处于零乱的和需要进一步条理化的档案，进行基本的分类、组合、排列、编号、编制目录、建立全宗等，组成有序体系的过程。
综合档案管理系统的具体步骤分为七步：一步是收集，整理人需要将所有文件收集起来。第二步是筛选，整理人需要将收集的文件按照章程进行一定的筛选。第三步是划分文件的类别和级别，第四步是确定文件的保管期限，第五步是修缮文件的内容，整理人需要根据章程修缮文件缺失的内容。第六步是给文件编号，第七步则是将文件装盒并且编制检索的目录。
综合档案管理系统的意义：档案是人们社会实践的真实记录，也是dang和国家进行经济建设，开展政治文明、物质文明、精神文明建设，发展科学文化技术的必要条件。1、准确反映企业的成长历程；2、防患企业商业秘密外泄；3、决策制订的参谋和帮手；4、企业文化的活标本；5、企业宣传的资料库；6、员工成长的断代史。