聚丙烯酰胺可用于工业废水处理：对于悬浮颗粒，较出、浓度高、粒子带阳电荷，水的PH值为中性或碱性的污水，钢铁厂废水，电镀厂废水，冶金废水，洗煤废水等污水处理，效好。饮用水处理：我国很多自来水厂的水源来自江河，泥沙及矿物质含量高，比较浑浊，虽经过沉淀过滤，仍不能达到要求，需要投加絮凝剂，投加量是无机絮凝剂的1/50，但效果是无机絮凝剂的几倍，对于有机物污染严重的江河水可采用无机絮凝剂和我公司的阳离子聚丙烯酰胺配合使用效果更好。
在聚丙烯酰胺的分子链内和分子链间，酰胺侧基间能形成氢键。氢键是强的分子间作用力，高分子量的聚丙烯酰胺分子链上存在大量的氢键；同时，高分子量的聚丙烯酰胺的分子链很长，长的分子链必然要卷曲，它们聚集在一起也必然缠结在一起。因此，要是聚丙烯酰胺快速溶解需要依靠溶剂水分子的快速渗入和攻击，净氢键解离和分子链解缠结。而聚丙烯酰胺的溶解速率与其分子量、离子度、分子的几何结构、溶解温度、搅拌和投料方式有关。溶解速率随分子量的增大和化学交联程度的增加而变慢，整体交联将使聚丙烯酰胺先溶账不溶解。
阳离子聚丙烯酰胺在酸性或碱性介质中均呈现阳电性，它通常会比阴离子或非离子型聚丙烯酰胺分子量低，其澄洁污水的性能主要是通过电荷中和作用而获得。这类絮凝剂的功能主要是絮凝带负的电荷，具有除浊、脱色功能。在酒精厂、味精厂、制糖厂、肉制品厂、饮料厂、印染厂的等废水处理中用阳离子聚丙烯酰胺要比用阴离子聚丙烯酰胺，非离子聚丙烯酰胺或无机盐效果要高数倍或数十倍，因为这类废水普遍带有阴电荷。目前使用水溶性偶氮引发剂AIBA等，已能将其分子量提高到千万以上。