冷库管理系统内嵌多种算法，可灵活计算货主的冷藏费用与其他费用，支持包仓与零仓等多种计算方式，也可自定义收费标准与自定义收费。
冷库管理系统具有欠费限额功能，企业可以在系统中设定欠费限额上限，如2000元，当货主欠费金额达到2000元时，系统会自动禁止该货主的货品出库，减少冷库的损失，直到货主缴清款项后才能恢复正常。
冷库管理系统是基于条码技术或RFID技术，借助PDA手持机扫描货品的条码来完成库内的各项业务的，其中随着扫描结束，相关的作业数据会自动采集同步到系统中，无需人工录入，且确保数据准确。