鸟类多样性监测系统主要被以下单位广泛使用：1. 生态保护机构：如国家公园、自然保护区、管理机构，它们需要这类系统来和保护珍稀鸟类种群，评估生态环境质量。2. 研究机构：大学的生态学、鸟类学研究部门，通过系统收集数据进行鸟类分布、迁徙、繁殖等科学研究。3. 非组织（NGO）：关注环境保护的非营利组织，利用该系统进行鸟类保护项目，提高公众对生物多样性的认识。4. 门：农业生态系统中的鸟类对害虫控制有重要作用，监测系统可帮助农民评估益鸟状况，指导农业生产。5. 城市规划部门：城市公园、绿地建设中，需要了解鸟类生态需求，以实现生态友好型城市建设。6. 旅业：鸟类丰富的地区常成为旅游热点，监测系统为旅游业提供生态旅游资源信息。7. 教育机构：用于教学和科普，让公众了解鸟类多样性及其保护的重要性。这些单位通过鸟类多样性监测系统获取数据，制定保护策略，进行教育宣传，并在实际工作中发挥着关键作用。