发酵罐控制部分：其功能主要是将测定元件测出的各种参数信号与预先确定值进行比较，并且输出信号指令执行元件进行调整控制。执行元件：它接受控制部分的指令开启、或关闭有关阀门、泵、开关等调节控制机构，使有关参数达到预定位置。关于控制方式，有手动控制和自动控制两类：手动控制：这是简易的控制方法。发酵罐的清洗工作也同样重要。
发酵罐基本要求结构严密，经得起蒸汽的反复灭菌，内壁光滑，耐腐蚀性能好，以利于灭菌减小金属离子对生物反应的影响;有良好的气一液一固接触和混合性能与的热量、质量、动量传递性能;在保持生物反应要求的前提下，降低发酵罐能耗;有良好的热量交换性能，以维持生物反应适温度;有可行的管路比例和仪表控制，适用于灭菌操作和自动化控制。
发酵罐搅拌器的维护：每次开罐盖后应检查并旋紧安装在搅拌轴上各部件中的止动螺钉。上磁钢位置的调整：上磁钢距罐底间距正常值为1-1.5mm，间距过小上磁钢的底面会触及罐体，这时会引起搅拌轴不能转动或搅拌轴有跳动并伴有较大的噪声现象出现；间距过大，这时会引起上下磁钢间的磁力减小，当发酵液粘稠时有可能搅拌器停转并伴有较大的噪声。