主要有：①一种牙齿类型的钻头，譬如适用于软地层的大牙齿钻头在中硬和硬地层中就不适用；②牙轮轴承的润滑不能始终保持一致钻头使用一段时间后，轴承内部往往混入固体颗粒，轴承因润滑不良造成过早地磨损；③牙轮外缘使用一段时间后，因磨损而使井径变小，往往增加了新钻头下到井底前的划眼工作。
由于钻头牙齿吃入地层加深，钻柱的转数加快，再配合适当的钻井液排量，钻井速度比刮刀钻头快得多。加之这种钻头对地层的软、中、硬有较大的适应能力，因而在钻井中得到广泛的使用。但是，随着石油勘探和开发要求钻井有更快的速度，牙轮钻头也逐渐出一些弱点
因刀片吃入地层不稳定，往往会发生跳钻和蹩钻，对钻柱的损伤很大，因扭矩过大经常发生钻杆折断和钻具粘扣等事故。另外，这种钻头的底部外缘极易磨损，使井眼的直径上大下小，俗称“塔式井眼”。井径不能保持一致，给钻进和井眼质量造成不良的后果。