有机肥料餐厨垃圾处理机将转运来的餐厨垃圾或果蔬垃圾等通过自动提升机倾倒入分拣平台，经人工分选将其中的塑料和纸质包装类垃圾以及少量玻璃瓶、金属物料、砖瓦等无机物料分选出来后，进入破碎机破碎分解，然后进入螺旋挤干机进行脱水处理，脱除下来的渗滤液进行油水分离后排入污水管道。挤压产生的含固率在百分之40以上的干物料经由皮带输送机送入高温搅拌发酵仓内进行高温好氧发酵处理。
有机肥料由于餐厨垃圾中含有各种动物肉类，如去做饲料，同类相食易引发和各种疾病，从而传播给人类而造成危害；去填埋由于其含水量高容易产生大量的渗滤液而污染地下水；做肥料，生产过程中臭味四溢，影响周围环境；而厌氧处理可产生大量沼气，沼气是一种清洁的可再生能源，可用于发电和做燃料，且由于系统全封闭而无异味，因此，餐厨垃圾厌氧处理是未来的发展方向。
有机肥料餐厨垃圾预处理机（机械处理机）采用物理原理，通过机械运动的方式对餐厨垃圾就地进行分拣去杂、破碎、脱水等处理，大限度的降低泔水的含水量和体积及重量，实现油水分离和污水处理，处理后的餐厨垃圾生成适合运输的有机物质运至集中有机肥料工厂，分离后的油脂运至生物柴油厂集中处理。