晋中水厂次氯酸钠消毒和杀菌主要的作用方式是通过它的水解作用形成次氯酸，次氯酸再进一步分解形成新生态氧[O]，新生态氧的极强氧化性使菌体和病毒的蛋白质变性，从而使病原微生物致死。
晋中水厂次氯酸钠的水溶液不稳定，一般常用次氯酸钠发生器通过电解盐水而获得，于临 用制备。原液含有效氯0.9% -1%。对多种细菌、真菌、病毒和支原体均有强大 的杀菌作用，常用于饮水、禽舍、环境、禽类加工厂、器械以及手臂的消毒。本品的用法与用量：饮水消毒:每1.5 -3升水加人次氯酸钠原液1毫升。环境与带禽消毒:按1/40水溶液喷雾。器械消毒:按1/150 -300水溶液浸泡。
晋中水厂次氯酸钠在杀菌、杀病毒过程中，不仅可作用于细胞壁、病毒外壳，而且因次氯酸分子小，不带电荷，还可渗透入菌（病毒）体内与菌（病毒）体蛋白、核酸和酶等发生氧化反应或破坏其磷酸脱氢酶，使糖代谢失调而致细胞死，从而杀掉病原微生物。