农村建集装箱别墅一般不违法，但是需要遵守相关规定并办理相应的手续。目前官方并没有明文禁止在乡村建造集装箱房屋，因为其具有可随意移动、重复拼装等特点，是一种较为环保且经济的住房选择。但需要注意的是，无论是对于原有的住宅进行翻新还是新建，都需要按规定到本地土地局以及住建部门了解相关的政策要求，依法依规建设，避免出现违建的情况发生。另外根据前几年全国人大常委会执法检查报告中的内容来看，国家立法明确集体经营性建设用地入市制度之后就可以允许农村自盖的房子通过正规渠道上市交易流通。不过具体还要考虑地方政策和规划等因素的影响。