常见的焊缝缺陷分外观缺陷和内部缺陷。外观缺陷可用肉眼观察到，内部缺陷需通过设备、仪器才能检查出来。焊缝缺陷影响焊缝有效截面面积，使焊缝金属的强度降低。裂纹缺陷还造成应力集中，有可能造成断裂。焊缝主要缺陷是咬边、未焊透与未熔合、夹渣、气孔和裂纹。其中，管管自动焊裂纹是焊接中不允许出现的一种严重缺陷，应采取措施予以防止
系统用配管用不锈钢无缝钢管时，管管自动焊常采用充氢气保护的弧焊工艺。焊接时要求除焊口外两侧管端均封死，对接管内允满气，并对焊口进行弧打底手弧填满。在不锈钢管进行焊接时一定要注意对接管内必须充满气，否则将无法保证焊接质量。未按焊接工艺要求施工，切开焊口区域，可发现焊口呈多孔海绵体状极不规则。
采用药芯焊丝加气体保护的焊接工艺，若是多遍成型，则每次焊缝表面清渣费工费时；若是强迫成型，则须配加一个与焊一起运动的成型铜滑块，并通入循环冷却水，可以大大提高管管自动焊效率，这样一来不仅焊接装置的结构复杂，而且重量增加。因为药芯焊丝的价格较高，同时还要解决保护气体的气源，所以焊接成本较高。单一使用自保护焊丝，虽然节省了保护气体，但存在清渣困难问题。